El Ceedo no protege datos. Protege sus propias configuraciones. Hasta allí.
Si quieres un programa que proteja datos con contraseña, puedes probar con
TrueCrypt o con
FreeOTFE; ambos son de encriptación mediante unidades virtuales.
El TrueCrypt tiene la única desventaja que necesita una PC con privilegios de administrador, pero el FreeOTFE tiene un programa adicional llamado FreeOTFE Explorer que te permite montar la unidad en PCs sin privilegios de admin.
De allí en adelante sería sólo mediante aplicaciones como las del U3.
A ver si algún programador me ayuda y hacemos un programita para proteger los datos de esa forma xD